Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06335 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06335 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06335 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P06335 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06335 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06335 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06335 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06335 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P06335 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P06335 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P06335 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P06335 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P06335 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P06335 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P06335 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P06335 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P06335 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P06335 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P06335 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms