Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P06321 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06321 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06321 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06321 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06321 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06321 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06321 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06321 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P06321 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06321 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06321 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06321 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06321 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06321 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06321 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06321 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06321 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06321 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06321 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06321 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06321 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06321 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
P06321 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06321 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06321 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06321 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06321 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06321 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06321 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06321 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06321 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06321 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06321 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06321 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06321 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06321 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06321 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06321 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P06321 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
P06321 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06321 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06321 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06321 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06321 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06321 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms