Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JunP05627 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JunP05627 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JunP05627 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JunP05627 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JunP05627 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
JunP05627 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
JunP05627 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
JunP05627 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
JunP05627 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JunP05627 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
JunP05627 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JunP05627 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JunP05627 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
JunP05627 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
JunP05627 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
JunP05627 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JunP05627 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
JunP05627 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
JunP05627 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
JunP05627 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
JunP05627 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
JunP05627 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
JunP05627 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JunP05627 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
JunP05627 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
JunP05627 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JunP05627 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JunP05627 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
JunP05627 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
JunP05627 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JunP05627 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
JunP05627 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
JunP05627 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
JunP05627 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
JunP05627 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JunP05627 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
JunP05627 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JunP05627 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JunP05627 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JunP05627 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JunP05627 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
JunP05627 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
JunP05627 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JunP05627 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JunP05627 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JunP05627 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JunP05627 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JunP05627 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
JunP05627 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
JunP05627 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms