Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd3dP04235 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd3dP04235 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cd3dP04235 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd3dP04235 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms