Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GzmbP04187 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GzmbP04187 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GzmbP04187 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms