Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01853 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P01853 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01853 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01853 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01853 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01853 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01853 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01853 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01853 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01853 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01853 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01853 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01853 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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