Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01801 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01801 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01801 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01801 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01801 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01801 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01801 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01801 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01801 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01801 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01801 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01801 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01801 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01801 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01801 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01801 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01801 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01801 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01801 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01801 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01801 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01801 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01801 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01801 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms