Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01800 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01800 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01800 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01800 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01800 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01800 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01800 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01800 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01800 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01800 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
P01800 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01800 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01800 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01800 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01800 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01800 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01800 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01800 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01800 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01800 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01800 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01800 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01800 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01800 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01800 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01800 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01800 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms