Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01790 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01790 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01790 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01790 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01790 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01790 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01790 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01790 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01790 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01790 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01790 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01790 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01790 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01790 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01790 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms