Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01788 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01788 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01788 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01788 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01788 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01788 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01788 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01788 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01788 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01788 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01788 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01788 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01788 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01788 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01788 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01788 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01788 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01788 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01788 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01788 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms