Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01786 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01786 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01786 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01786 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01786 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01786 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01786 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01786 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01786 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms