Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01747 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01747 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01747 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01747 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01747 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01747 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01747 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01747 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01747 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01747 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
P01747 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01747 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01747 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01747 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01747 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01747 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms