Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01650 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01650 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P01650 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P01650 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01650 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01650 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P01650 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
P01650 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01650 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01650 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01650 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P01650 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P01650 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01650 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01650 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01650 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01650 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P01650 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01650 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
P01650 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01650 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01650 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01650 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01650 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01650 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
P01650 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P01650 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01650 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01650 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01650 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01650 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01650 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01650 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01650 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01650 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01650 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01650 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01650 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01650 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01650 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01650 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01650 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01650 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01650 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01650 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01650 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P01650 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01650 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01650 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01650 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
P01650 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01650 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01650 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01650 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01650 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01650 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01650 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01650 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01650 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01650 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01650 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01650 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01650 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01650 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01650 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01650 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01650 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01650 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms