Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P01649 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01649 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01649 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01649 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01649 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01649 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01649 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01649 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01649 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01649 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01649 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01649 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01649 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01649 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01649 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01649 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01649 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01649 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P01649 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P01649 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P01649 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms