Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01648 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01648 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01648 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01648 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01648 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01648 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01648 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01648 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01648 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01648 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01648 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01648 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01648 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01648 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01648 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
P01648 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01648 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01648 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01648 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01648 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01648 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01648 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01648 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01648 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01648 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01648 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01648 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01648 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01648 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01648 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01648 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01648 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01648 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01648 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01648 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01648 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01648 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01648 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01648 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01648 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01648 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01648 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01648 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01648 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01648 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01648 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01648 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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