Protein–RNA interactions for Protein: P01646

Ig kappa chain V-V region HP 123E6, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01646 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01646 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01646 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01646 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01646 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01646 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01646 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01646 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01646 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01646 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01646 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01646 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01646 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
P01646 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01646 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01646 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01646 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01646 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01646 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01646 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01646 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01646 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
P01646 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01646 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01646 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01646 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01646 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01646 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
P01646 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P01646 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
P01646 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01646 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
P01646 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01646 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01646 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P01646 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
P01646 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01646 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms