Protein–RNA interactions for Protein: P00860

Odc1, Ornithine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1P00860 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Odc1P00860 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Odc1P00860 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odc1P00860 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odc1P00860 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Odc1P00860 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms