Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopeO89079 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopeO89079 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopeO89079 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopeO89079 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopeO89079 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CopeO89079 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CopeO89079 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CopeO89079 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CopeO89079 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CopeO89079 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopeO89079 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopeO89079 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopeO89079 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopeO89079 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CopeO89079 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CopeO89079 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CopeO89079 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CopeO89079 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopeO89079 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CopeO89079 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopeO89079 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopeO89079 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopeO89079 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopeO89079 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CopeO89079 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CopeO89079 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopeO89079 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopeO89079 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopeO89079 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopeO89079 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CopeO89079 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopeO89079 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopeO89079 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CopeO89079 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopeO89079 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CopeO89079 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CopeO89079 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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