Protein–RNA interactions for Protein: O89051

Itm2b, Integral membrane protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2bO89051 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itm2bO89051 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itm2bO89051 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itm2bO89051 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms