Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrrc6O88978 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc6O88978 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms