Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
F11rO88792 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
F11rO88792 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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F11rO88792 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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F11rO88792 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
F11rO88792 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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F11rO88792 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
F11rO88792 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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F11rO88792 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
F11rO88792 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
F11rO88792 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
F11rO88792 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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