Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1O88746 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tom1O88746 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tom1O88746 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1O88746 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1O88746 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tom1O88746 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1O88746 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tom1O88746 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tom1O88746 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tom1O88746 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms