Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd7O88665 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd7O88665 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Brd7O88665 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd7O88665 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd7O88665 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd7O88665 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd7O88665 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd7O88665 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd7O88665 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms