Protein–RNA interactions for Protein: O88324

Cd83, CD83 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd83O88324 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cd83O88324 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd83O88324 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms