Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nid2O88322 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nid2O88322 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nid2O88322 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nid2O88322 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nid2O88322 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nid2O88322 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nid2O88322 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms