Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clec11aO88200 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clec11aO88200 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clec11aO88200 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms