Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Stag3O70576 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stag3O70576 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stag3O70576 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Stag3O70576 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stag3O70576 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stag3O70576 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stag3O70576 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag3O70576 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag3O70576 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag3O70576 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag3O70576 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag3O70576 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Stag3O70576 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms