Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hcn4O70507 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hcn4O70507 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcn4O70507 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcn4O70507 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcn4O70507 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hcn4O70507 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms