Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xirp1O70373 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xirp1O70373 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xirp1O70373 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms