Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtssO70370 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtssO70370 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtssO70370 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CtssO70370 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtssO70370 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtssO70370 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtssO70370 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtssO70370 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtssO70370 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtssO70370 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtssO70370 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtssO70370 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtssO70370 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtssO70370 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CtssO70370 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CtssO70370 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CtssO70370 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CtssO70370 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtssO70370 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CtssO70370 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtssO70370 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtssO70370 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CtssO70370 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CtssO70370 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CtssO70370 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CtssO70370 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtssO70370 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtssO70370 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtssO70370 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtssO70370 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CtssO70370 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms