Protein–RNA interactions for Protein: O70343

Ppargc1a, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1aO70343 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ppargc1aO70343 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ppargc1aO70343 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppargc1aO70343 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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