Protein–RNA interactions for Protein: O70218

Hmx1, Homeobox protein HMX1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx1O70218 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hmx1O70218 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hmx1O70218 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hmx1O70218 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hmx1O70218 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms