Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp2a2O55143 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2a2O55143 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms