Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif6O55135 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif6O55135 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Eif6O55135 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eif6O55135 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif6O55135 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Eif6O55135 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif6O55135 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Eif6O55135 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms