Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrxO55103 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PrxO55103 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PrxO55103 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PrxO55103 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PrxO55103 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PrxO55103 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PrxO55103 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PrxO55103 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PrxO55103 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PrxO55103 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PrxO55103 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PrxO55103 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PrxO55103 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrxO55103 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrxO55103 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrxO55103 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PrxO55103 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PrxO55103 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrxO55103 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrxO55103 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrxO55103 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrxO55103 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrxO55103 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PrxO55103 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PrxO55103 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PrxO55103 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PrxO55103 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PrxO55103 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PrxO55103 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PrxO55103 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PrxO55103 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PrxO55103 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PrxO55103 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PrxO55103 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PrxO55103 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PrxO55103 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PrxO55103 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PrxO55103 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PrxO55103 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PrxO55103 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrxO55103 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrxO55103 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrxO55103 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrxO55103 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PrxO55103 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PrxO55103 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PrxO55103 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PrxO55103 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PrxO55103 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PrxO55103 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PrxO55103 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PrxO55103 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PrxO55103 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PrxO55103 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PrxO55103 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PrxO55103 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PrxO55103 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PrxO55103 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PrxO55103 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PrxO55103 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PrxO55103 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms