Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nck2O55033 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nck2O55033 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nck2O55033 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nck2O55033 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nck2O55033 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nck2O55033 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nck2O55033 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nck2O55033 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nck2O55033 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms