Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc3O55013 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc3O55013 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc3O55013 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms