Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SlkO54988 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SlkO54988 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SlkO54988 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SlkO54988 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SlkO54988 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SlkO54988 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SlkO54988 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SlkO54988 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SlkO54988 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SlkO54988 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SlkO54988 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SlkO54988 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SlkO54988 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SlkO54988 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SlkO54988 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SlkO54988 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SlkO54988 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SlkO54988 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SlkO54988 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SlkO54988 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SlkO54988 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SlkO54988 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SlkO54988 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SlkO54988 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SlkO54988 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SlkO54988 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SlkO54988 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SlkO54988 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SlkO54988 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SlkO54988 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SlkO54988 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SlkO54988 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SlkO54988 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SlkO54988 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SlkO54988 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SlkO54988 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SlkO54988 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SlkO54988 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms