Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnk2O54967 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnk2O54967 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnk2O54967 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk2O54967 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk2O54967 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk2O54967 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnk2O54967 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnk2O54967 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnk2O54967 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms