Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NlkO54949 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NlkO54949 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NlkO54949 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NlkO54949 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NlkO54949 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NlkO54949 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NlkO54949 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NlkO54949 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NlkO54949 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NlkO54949 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NlkO54949 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NlkO54949 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NlkO54949 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NlkO54949 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NlkO54949 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NlkO54949 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NlkO54949 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NlkO54949 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NlkO54949 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NlkO54949 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NlkO54949 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NlkO54949 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NlkO54949 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NlkO54949 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NlkO54949 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms