Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Csnk2a2O54833 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Csnk2a2O54833 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms