Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DffaO54786 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DffaO54786 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DffaO54786 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DffaO54786 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DffaO54786 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DffaO54786 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DffaO54786 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DffaO54786 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DffaO54786 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DffaO54786 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DffaO54786 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DffaO54786 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DffaO54786 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DffaO54786 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DffaO54786 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DffaO54786 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DffaO54786 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DffaO54786 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DffaO54786 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DffaO54786 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DffaO54786 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DffaO54786 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DffaO54786 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DffaO54786 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DffaO54786 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DffaO54786 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DffaO54786 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DffaO54786 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DffaO54786 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DffaO54786 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DffaO54786 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DffaO54786 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DffaO54786 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DffaO54786 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DffaO54786 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DffaO54786 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DffaO54786 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DffaO54786 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DffaO54786 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms