Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cavin1O54724 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cavin1O54724 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cavin1O54724 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms