Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf12O35738 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf12O35738 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klf12O35738 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms