Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sptlc1O35704 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sptlc1O35704 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sptlc1O35704 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms