Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx1aO35526 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx1aO35526 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx1aO35526 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms