Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edil3O35474 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edil3O35474 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Edil3O35474 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edil3O35474 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Edil3O35474 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edil3O35474 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edil3O35474 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Edil3O35474 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edil3O35474 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Edil3O35474 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Edil3O35474 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms