Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clcn6O35454 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Clcn6O35454 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clcn6O35454 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms