Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TnxbO35452 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TnxbO35452 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TnxbO35452 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TnxbO35452 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms