Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrt1O35449 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prrt1O35449 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms